A LabDAO feltérképezi a nyílt forráskódú mesterséges intelligencia jövőjét a kábítószer-felfedezés terén

A Folding@home projekt a COVID-19 világjárvány során a címlapokra került a fel nem használt számítási teljesítmény felosztásáról, hogy feltárja a fehérjehajtogatás keresési területét az új koronavírus elleni küzdelem érdekében. A kezdeményezés lehetővé tette a polgárok számára, hogy önálló tudósok lehessenek, nagy léptékű szimulációkat futtattak le a fehérjék különböző molekuláris konfigurációiról a „bejegyzett” számítógépek elosztott hálózatán szerte a világon.

Ezt a decentralizált paradigmát azzal a céllal hirdették, hogy összehozza az embereket egy közös probléma körül, és hatékonyan gyűjtse össze a számítási teljesítményt, de mi van, ha a számítási teljesítmény és a problémamegoldó infrastruktúra felcserélődik? Más szóval, mi lenne, ha az egyének a felhalmozott számítási teljesítmény kihasználásával saját projektjeit futtathatnák és a a biológiai kísérletezés eszközei a rendszerindításhoz?

A LabDAO ezt az álmot valóra váltja PLEX platformjával. A PLEX egy nyílt forráskódú parancssori eszköz, amelyet arra terveztek, hogy ne csak a számítási erőforrásokat, hanem a különféle biológiai-gépi tanulási eszközöket is elérhetővé tegye (a LabDAO-n belül a „BioML” programcsomagot alkotta meg) különféle háttérrel. Akár kismolekulájú dokkoló, akár saját fehérjehajtogatási szimulációkkal kísérletezik, a PLEX lehetővé teszi a felhasználók számára, hogy hozzáférjenek a LabDAO eszköztárához, megosszák az eredményeket, és kevesebb mint öt perc alatt megjelenítsék azokat.

Ezt az eszközcsomagot és a rajta lévő, használatot lehetővé tevő platformot a Zuzalu által április elején megrendezett Blockchain Meets Biology csúcstalálkozón mutatták be, ahol a LabDAO Core Team tagja, Lily Hansen-Gillis az elejétől a végéig bemutatta a belső molekuláris dinamika szimulációját. fehérjét, hogy megtalálja a legstabilabb konfigurációját. Aztán, mint egy „nem kódoló”, végigvezette a közönséget az elejétől a végéig – mindezt számítógéppel, WiFi-vel, PLEX-szel a parancssorban, és semmi mással.

Tágabb értelemben a LabDAO egy web3-kompatibilis decentralizált platform (a nagyobb „DeSci” mozgalom része), amely elkötelezett amellett, hogy termelékenyebb környezetet teremtsen a nyílt forráskódú gyógyszerkutatáshoz. Az élvonalbeli eszközök és erőforrások szélesebb ökoszisztéma számára történő elérhetővé tételével a LabDAO célja, hogy megfelelő környezetet teremtsen az átlátható és hozzáférhető tudományos fejlődéshez. Akár azáltal, hogy kiküszöböli a kutatóknak saját hardverrel vagy számítástechnikai infrastruktúrával, akár a kísérletek eredményeinek blokklánc-könyvben való közzétételével, hogy azok nyomon követhetőek és reprodukálhatóak legyenek, a szervezet elkötelezett amellett, hogy együttműködésen keresztül több innovációt tegyen lehetővé – lebontva a szegénység okozta akadályokat. használhatóság és silózott, niche szakértelem.

A LabDAO arra irányuló erőfeszítései, hogy ezt a jövő DeSci-világát a mai napra építse, a közelmúltban egy 3.6 millió dolláros finanszírozási kör formájában lendületet kapott számos más DAO-tól, az Inflection.xyz-től, a Balaji Srinivasantól és másoktól. Ez a beáramló támogatás hozzájárul a nyílt forráskódú szoftvereszközök kifejlesztésére és a LabDAO kutatási ökoszisztémájának megerősítésére irányuló folyamatos erőfeszítésekhez.

Ami magát a PLEX-et illeti, a közeljövőben a következő lépések közé tartozik a platform tesztelése különböző tudományos együttműködésekben, különféle eszközök konténerbe helyezése és a BioML hálózat támogatásához szükséges hardver felhalmozása.

Ami hosszú távot illeti, talán a következő életmentő gyógyszert a következő jelentős fertőző betegség kitörése során a PLEX erejével tervezik meg, egy decentralizált lépéssel előre. Ahogy az ökoszisztéma folyamatosan növekszik, csak az idő fogja eldönteni.

Köszönöm Aishani Aatresh a cikkhez kapcsolódó további kutatásokhoz és jelentésekhez. Én vagyok a SynBioBeta alapítója, és néhány cég, amelyekről írok, a szponzora a SynBioBeta konferencia. További tartalmakért előfizethetsz az én heti hírlevelem.